×
В России создадут первую в мире систему по анализу Big Data микробиоты

Резидент Фонда «Сколково», компания «Кномикс», вошедшая в биомедицинский холдинг «Атлас», получила от Фонда грант в размере 30 млн рублей. Грант будет использован для разработки электронной системы анализа данных микробиоты кишечника человека — популяций бактерий, которые определяют метаболизм многих питательных веществ и витаминов, формируют иммунитет и противостоят заболеваниям. Система будет включать в себя базу данных и непосредственно алгоритм их анализа. Этот инструмент на стыке медицины и big data позволит врачам точнее определять развитие различных заболеваний, а бизнесу – использовать уникальную информацию о бактериях человека и об их влиянии на организм для разработки эффективных решений. Так, фармацевтические и пищевые компании наиболее заинтересованы в этой системе, благодаря которой первые смогут создавать более таргетированные лекарства, вторые – продукты питания, поддерживающие микробиоту. Планируется, что система будет доступна пользователям во всем мире в течение года.

 

Компания была основана в 2014 году и стала первым в России проектом, который занялся исследованием микробиоты кишечника. Ученые-микробиологи и биоинформатики «Кномикса» провели тысячи тестов микробиоты по всей стране и смогли определить, какие конфигурации микробиоты являются оптимальными для россиян, и как воздействовать на бактерии, чтобы достигнуть баланса. Знания о каждой отдельной группе микробов в нашем кишечнике также позволяют определять те или иные изменения в нашем организме, в том числе и развития различных болезней.

 

Наиболее активно технологии исследования микробиоты развиваются в Европе и США, где реализуются государственные программы, а также появляются частные компании, которые предлагают такие анализы врачам и пациентам. Так, например, в конце 2016 года проект uBiome, предлагающий персональное тестирование микробиоты кишечника, получил инвестиции раунда B в размере $15.5 млн.

 

«Кномикс» стала первой компанией, которая собрала экспертную команду, чтобы создать сервис, объединяющий все эти данные и привязывающий их к питанию и здоровью.

 

Кирилл Каем, Вице-Президент, Исполнительный директор кластера биологических и медицинских технологий Фонда «Сколково»:

«Сегодня на глобальном биомедицинском рынке нет решений, которые бы позволили собрать и проанализировать в одном месте всю информацию об исследованиях микробиоты, чтобы на выходе эти обширные данные могли бы использовать все – от пациентов и врачей до бизнеса. Продукт команды на стыке big data и биомедицины будет крайне востребован как в России, так и по всему миру. Потенциальный объем только российского рынка в перспективе 5-7 лет составляет несколько миллиардов рублей. Важность разработок по данному направлению подчеркивает включение целого раздела по вопросам микробиоты в  проект Федерального Закона "О биологической безопасности РФ».

К 2018 году команда биоинформатиков, генетиков и ученых разработает рабочий прототип системы, включающий блоки по сбору, хранению и анализу данных, а также сам облачный сервис и алгоритм расчета возможных терапевтических эффектов. Кроме того, компания должна будет провести тестирование системы с участием минимум 200 пациентов. Подобное исследование компания «Кномикс» уже успешно проводила совместно с биомедицинским холдингом «Атлас» в рамках первого в России краудфандингового проекта по персонализированному исследованию микробиома человека. Тогда участие в нем приняло около 300 человек.

 

В системе будет постоянно обновляться информация о последних исследованиях популяций бактерий в кишечнике у людей по всему миру. Определять количественный бактериальный состав кишечника позволяет технология секвенирования 16S рибосомальной РНК. Анализ этих данных будет давать информацию о воздействии препаратов и питания на микробиоту, что позволит предотвращать развитие заболеваний всего лишь за счет смены рациона питания.

 

Дмитрий Алексеев, генеральный директор компании «Кномикс» и директор по R&D биомедицинского холдинга «Атлас»

«На развитие заболеваний влияют много факторов: экология, генетика, образ жизни — многие из которых невозможно изменить. Но можно предотвратить сложные заболевания и их последствия за счет изменения питания по результатам анализа бактерий в кишечнике. Это, наверное, самый простой, но в то же время эффективный способ воздействия на здоровье».