×
Новое лекарство «придумает» суперкомпьютер

Японские ученые начали использовать суперкомпьютер для разработки новых лекарств. Их цель – сделать так, чтобы было возможным ввести в компьютер протеин, вызывающий заболевание, и на выходе получить химическое соединение, которое с высокой долей вероятности станет эффективным лекарством. Об исследованиях рассказал портал diginfo.tv.

 

Расчеты подобного рода стали возможными благодаря суперкомпьютеру K, расположенному в японском городе Кобе. В 2011-м году это был самый быстрый в мире компьютер. Он выполняет 10 квадриллионов вычислений в секунду (1 квадриллион – это единица с 15 нулями). В ходе компьютерного эксперимента было смоделировано взаимодействие для порядка 600 различных протеинов, связанных с заболеваниями, и 30 млн химических соединений.

Вероятность полученных прогнозов для рассчитанных взаимодействий удовлетворила ученых.


Методику создания лекарств с помощью вычислительных методов разработал профессор Ясуши Окуно (Yasushi Okuno) из Киотского университета. Он полагает, что «суперкомпьютер K позволяет проводить расчеты с беспрецедентной точностью, что помогает разрабатывать методы создания лекарств, которые будут эффективными при лечении заболеваний, вызываемых протеинами». Компьютерный эксперимент стал возможным благодаря тому, что сразу несколько фармацевтических компаний поделились своими данными, создав, таким образом, экспериментальную базу для компьютерного моделирования.


В проекте участвуют 11 фармацевтических компаний. Ученых и бизнесменов вместе собрала японская организация BioGrid Center Kansai, расположенная в Осаке. Она координирует деятельность участников проекта и задает направление для исследований. Будучи созданной еще в 2004 году, организация взяла курс на использование информационных технологий в медицине. «Нам стало интересно выяснить возможность использования суперкомпьютера для фармацевтической индустрии, например для создания новых лекарств», – рассказал Риучи Шимизу (Ryuichi Shimizu), директор BioGrid Center Kansai.


Сегодня точность предсказаний, сделанных с помощью обычных компьютерных методов, составляет 5 %. Профессор Окуно ставит перед собой цель увеличить этот показатель. Он сообщил: «Моя мечта – с помощью суперкомпьютера K, а возможно, и с помощью суперкомпьютера следующего поколения достигнуть точности прогнозов в 70 %. Я уверен, что создание лекарств на основе IT-методов скоро станет возможным».


Автор: Геннадий Хворых
Источник фотографий: RIKEN